Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ALS2CR12Q96Q35 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms