Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF3Q96PU9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms