Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP4Q96MN2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP4Q96MN2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP4Q96MN2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms