Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf85Q96MD7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms