Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FAM227BQ96M60 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM227BQ96M60 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms