Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TMEM87BQ96K49 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM87BQ96K49 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM87BQ96K49 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms