Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIC2Q96JB3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIC2Q96JB3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIC2Q96JB3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms