Protein–RNA interactions for Protein: Q96J84

KIRREL1, Kin of IRRE-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL1Q96J84 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KIRREL1Q96J84 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KIRREL1Q96J84 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KIRREL1Q96J84 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KIRREL1Q96J84 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KIRREL1Q96J84 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KIRREL1Q96J84 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
KIRREL1Q96J84 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KIRREL1Q96J84 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KIRREL1Q96J84 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KIRREL1Q96J84 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms