Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPNQ96H22 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPNQ96H22 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPNQ96H22 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms