Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLIP3Q96DZ5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIP3Q96DZ5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP3Q96DZ5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP3Q96DZ5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP3Q96DZ5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP3Q96DZ5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIP3Q96DZ5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms