Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTP4Q96DX8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTP4Q96DX8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP4Q96DX8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms