Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC39Q96DD0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC39Q96DD0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC39Q96DD0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms