Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF653Q96CK0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF653Q96CK0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF653Q96CK0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms