Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYTL4Q96C24 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYTL4Q96C24 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SYTL4Q96C24 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SYTL4Q96C24 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SYTL4Q96C24 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SYTL4Q96C24 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SYTL4Q96C24 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYTL4Q96C24 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYTL4Q96C24 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYTL4Q96C24 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SYTL4Q96C24 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SYTL4Q96C24 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYTL4Q96C24 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYTL4Q96C24 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms