Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EXOSC8Q96B26 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EXOSC8Q96B26 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms