Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VTI1AQ96AJ9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VTI1AQ96AJ9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms