Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRIM52Q96A61 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRIM52Q96A61 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM52Q96A61 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms