Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LHX4Q969G2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX4Q969G2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms