Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP7Q93009 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP7Q93009 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP7Q93009 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP7Q93009 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP7Q93009 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP7Q93009 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP7Q93009 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP7Q93009 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP7Q93009 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP7Q93009 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP7Q93009 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP7Q93009 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP7Q93009 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP7Q93009 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP7Q93009 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP7Q93009 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP7Q93009 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP7Q93009 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP7Q93009 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP7Q93009 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP7Q93009 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP7Q93009 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP7Q93009 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP7Q93009 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP7Q93009 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP7Q93009 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP7Q93009 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP7Q93009 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP7Q93009 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP7Q93009 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP7Q93009 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP7Q93009 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP7Q93009 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP7Q93009 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP7Q93009 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP7Q93009 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP7Q93009 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP7Q93009 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP7Q93009 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP7Q93009 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP7Q93009 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP7Q93009 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP7Q93009 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP7Q93009 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP7Q93009 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP7Q93009 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP7Q93009 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP7Q93009 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP7Q93009 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP7Q93009 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP7Q93009 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP7Q93009 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP7Q93009 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP7Q93009 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP7Q93009 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP7Q93009 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP7Q93009 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP7Q93009 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP7Q93009 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP7Q93009 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP7Q93009 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP7Q93009 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP7Q93009 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP7Q93009 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP7Q93009 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP7Q93009 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP7Q93009 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP7Q93009 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP7Q93009 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP7Q93009 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP7Q93009 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP7Q93009 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP7Q93009 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP7Q93009 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP7Q93009 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP7Q93009 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP7Q93009 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP7Q93009 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP7Q93009 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP7Q93009 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP7Q93009 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP7Q93009 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP7Q93009 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP7Q93009 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP7Q93009 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP7Q93009 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP7Q93009 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP7Q93009 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP7Q93009 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP7Q93009 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP7Q93009 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP7Q93009 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP7Q93009 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP7Q93009 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP7Q93009 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP7Q93009 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP7Q93009 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP7Q93009 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP7Q93009 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms