Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLP1Q92989 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms