Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EDAQ92838 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDAQ92838 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDAQ92838 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDAQ92838 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDAQ92838 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDAQ92838 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDAQ92838 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDAQ92838 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDAQ92838 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDAQ92838 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDAQ92838 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDAQ92838 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDAQ92838 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDAQ92838 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDAQ92838 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDAQ92838 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDAQ92838 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDAQ92838 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EDAQ92838 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDAQ92838 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDAQ92838 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
EDAQ92838 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDAQ92838 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDAQ92838 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDAQ92838 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDAQ92838 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDAQ92838 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDAQ92838 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDAQ92838 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDAQ92838 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDAQ92838 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EDAQ92838 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDAQ92838 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDAQ92838 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDAQ92838 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDAQ92838 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDAQ92838 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDAQ92838 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EDAQ92838 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDAQ92838 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDAQ92838 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDAQ92838 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EDAQ92838 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDAQ92838 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDAQ92838 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EDAQ92838 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDAQ92838 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDAQ92838 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDAQ92838 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDAQ92838 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDAQ92838 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDAQ92838 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDAQ92838 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDAQ92838 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDAQ92838 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDAQ92838 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDAQ92838 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDAQ92838 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDAQ92838 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDAQ92838 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDAQ92838 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDAQ92838 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDAQ92838 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDAQ92838 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDAQ92838 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EDAQ92838 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDAQ92838 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDAQ92838 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDAQ92838 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDAQ92838 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDAQ92838 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EDAQ92838 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDAQ92838 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EDAQ92838 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDAQ92838 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDAQ92838 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EDAQ92838 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EDAQ92838 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EDAQ92838 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EDAQ92838 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EDAQ92838 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EDAQ92838 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDAQ92838 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDAQ92838 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDAQ92838 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDAQ92838 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EDAQ92838 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDAQ92838 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDAQ92838 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDAQ92838 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDAQ92838 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDAQ92838 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDAQ92838 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDAQ92838 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDAQ92838 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDAQ92838 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDAQ92838 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDAQ92838 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDAQ92838 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms