Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HTRA1Q92743 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms