Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXQ3

LINC01599, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01599, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01599Q8WXQ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01599Q8WXQ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01599Q8WXQ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms