Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC44A1Q8WWI5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC44A1Q8WWI5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC44A1Q8WWI5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC44A1Q8WWI5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC44A1Q8WWI5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC44A1Q8WWI5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC44A1Q8WWI5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC44A1Q8WWI5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC44A1Q8WWI5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC44A1Q8WWI5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC44A1Q8WWI5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC44A1Q8WWI5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms