Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf54Q8WWF1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf54Q8WWF1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf54Q8WWF1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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