Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJA4Q8WW22 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJA4Q8WW22 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJA4Q8WW22 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJA4Q8WW22 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJA4Q8WW22 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJA4Q8WW22 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJA4Q8WW22 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJA4Q8WW22 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJA4Q8WW22 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJA4Q8WW22 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms