Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCFD1Q8WVM8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCFD1Q8WVM8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCFD1Q8WVM8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms