Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVH0

CPLX3, Complexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPLX3Q8WVH0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPLX3Q8WVH0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPLX3Q8WVH0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPLX3Q8WVH0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms