Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3IP1Q8TDR0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF3IP1Q8TDR0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms