Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HAVCR2Q8TDQ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HAVCR2Q8TDQ0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HAVCR2Q8TDQ0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms