Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIN3Q8TB24 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIN3Q8TB24 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIN3Q8TB24 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms