Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI29

FBXO27, F-box only protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO27Q8NI29 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FBXO27Q8NI29 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO27Q8NI29 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO27Q8NI29 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO27Q8NI29 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO27Q8NI29 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO27Q8NI29 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO27Q8NI29 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO27Q8NI29 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO27Q8NI29 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO27Q8NI29 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO27Q8NI29 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO27Q8NI29 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO27Q8NI29 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO27Q8NI29 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO27Q8NI29 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO27Q8NI29 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO27Q8NI29 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms