Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KNL1Q8NG31 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KNL1Q8NG31 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms