Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
AGBL3Q8NEM8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AGBL3Q8NEM8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AGBL3Q8NEM8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AGBL3Q8NEM8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AGBL3Q8NEM8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
AGBL3Q8NEM8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
AGBL3Q8NEM8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AGBL3Q8NEM8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AGBL3Q8NEM8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AGBL3Q8NEM8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms