Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF169Q8NCN4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF169Q8NCN4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF169Q8NCN4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms