Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RDH13Q8NBN7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RDH13Q8NBN7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RDH13Q8NBN7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
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