Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBL4BQ8N7F7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBL4BQ8N7F7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBL4BQ8N7F7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBL4BQ8N7F7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBL4BQ8N7F7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBL4BQ8N7F7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBL4BQ8N7F7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBL4BQ8N7F7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBL4BQ8N7F7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBL4BQ8N7F7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms