Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGI4Q8N135 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LGI4Q8N135 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGI4Q8N135 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms