Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN4XQ8N0W4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN4XQ8N0W4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms