Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC13Q8IYE1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC13Q8IYE1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms