Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUR5

TMTC1, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC1Q8IUR5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMTC1Q8IUR5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMTC1Q8IUR5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMTC1Q8IUR5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMTC1Q8IUR5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMTC1Q8IUR5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms