Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPRSS6Q8IU80 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPRSS6Q8IU80 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMPRSS6Q8IU80 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms