Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX32Q86XE0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX32Q86XE0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms