Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RBBP6Q7Z6E9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RBBP6Q7Z6E9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms