Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NANOGNBQ7Z5D8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGNBQ7Z5D8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGNBQ7Z5D8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGNBQ7Z5D8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGNBQ7Z5D8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGNBQ7Z5D8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGNBQ7Z5D8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NANOGNBQ7Z5D8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NANOGNBQ7Z5D8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NANOGNBQ7Z5D8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms