Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMC6Q7Z403 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMC6Q7Z403 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMC6Q7Z403 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms