Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC46A3Q7Z3Q1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms