Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J2

C16orf62, UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62Q7Z3J2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C16orf62Q7Z3J2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C16orf62Q7Z3J2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C16orf62Q7Z3J2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms