Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
APTXQ7Z2E3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APTXQ7Z2E3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APTXQ7Z2E3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms