Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCXQ7RTU7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SCXQ7RTU7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms